Một thách thức kỹ thuật là môi trường hóa học của não có thể khiến nhiều loại nhựa dần bị hư hỏng.[7] Một thách thức khác đối với cấy ghép điện cực mãn tính là phản ứng viêm đối với cấy ghép não.[21][22] Việc truyền tin nhắn hóa học qua tế bào thần kinh bị cản trở bởi một vết sẹo thần kinh hình thành rào cản xảy ra trong vòng vài tuần sau khi chèn, sau đó là thoái hóa thần kinh tiến triển, làm giảm độ nhạy tín hiệu. Hơn nữa, các điện cực mỏng mà Neuralink sử dụng, có khả năng bị phá vỡ hơn các điện cực dày hơn và hiện không thể loại bỏ khi bị vỡ hoặc khi vô dụng sau khi hình thành sẹo lồi.[23] Trong khi đó, các điện cực vẫn còn quá lớn để ghi lại sự bắn của từng nơ-ron riêng lẻ, vì vậy chúng chỉ có thể ghi lại sự bắn của một nhóm nơ-ron. Vấn đề này có thể được giảm thiểu theo thuật toán, nhưng điều này là tốn kém về mặt tính toán và không mang lại kết quả chính xác.